Repository: https://github.com/snap-stanford/BioDiscoveryAgent Stars: 113 | Forks: 26 | Language: Python | License: MIT 最後更新: 2026-07-12 | 論文: arXiv:2405.17631 1. 專案概覽 (Project Overview) 1.1 這是什麼 BioDiscoveryAgent 是一個由 大型語言模型 (LLM; Large Language Model) 驅動的 AI 代理人 (AI agent; 人工智慧代理人)，用途是自動設計 基因擾動實驗 (genetic...
Repository: https://github.com/snap-stanford/Biomni Stars: 3399 | Forks: 618 | Language: Python | License: Apache License 2.0 官網: https://biomni.stanford.edu | 論文: bioRxiv 2025.05.30.656746 1. 專案概覽 (Project Overview) 1.1 這是什麼 Biomni 是史丹佛大學 SNAP（Stanford Network Analysis Project）團隊開發的一個通用型生物醫學 AI agent (general-purpose...
Medical Research Skills 完整教學 1. 專案定位與核心價值 這是什麼？ Medical Research Skills 是由 AIPOCH 團隊開發的開源醫學研究 AI Agent Skill 庫，收錄 554+ 個結構化 SKILL.md 檔案。這些 skill 並非傳統意義上的「程式碼套件」，而是為 AI agent 提供的領域知識指令集：每個 SKILL.md 定義了一個特定醫學研究任務的完整工作流程、判斷邏輯與品質檢核標準。 為什麼需要它？ 醫學研究涉及高度專業化的工作流 — 從 PubMed 搜索策略建構、臨床試驗設計、單細胞 RNA-seq 分析到 SCI 稿件撰寫 — 每個環節都有嚴格的方法學...
AlphaGenome – Google DeepMind DNA 調控密碼統一模型完整教學 AlphaGenome 是 Google DeepMind 開發的統一基因體模型 (unified genomic model)，能從 DNA 序列 (DNA sequence) 同時預測 gene expression (基因表現)、splicing patterns (剪接模式)、chromatin features (染色質特徵) 與 contact maps (接觸圖譜)，最長可分析 100 萬鹼基對，並達到 single base-pair resolution (單鹼基解析度)。 論文：Avsec et al., Nature...
Drug repositioning pre-IND 擴充版教學下篇：§6 候選分子落地、§7 Payer、§8 案例研究、§9 決策框架、§10 教訓與附錄 A-F
Drug repositioning pre-IND 擴充版教學上篇：§1 執行摘要、§2 MIT 三問、§3 FDA/EMA/PMDA 法規流程、§4 疾病深探、§5 三管線分析
AbLang 完整教學 Repository: https://github.com/oxpig/AbLang Stars: 165 | Forks: 31 | License: BSD 3-Clause Tags: antibody, language-model, semantic, protein-sequences Language: Python | Version: 0.2.4 Paper: AbLang: An antibody language model for completing antibody sequences (Olsen et al., 2022) 2. 核心架構 2.1 模型整體架構 graph...
biomed-multi-alignment (MAMMAL) 完整教學 Repository: https://github.com/BiomedSciAI/biomed-multi-alignment Stars: 109 | Tags: IBM, multimodal, foundation License: Apache-2.0 | Language: Jupyter Notebook / Python arXiv: 2410.22367 Model Weights: ibm/biomed.omics.bl.sm.ma-ted-458m 2. 核心架構 2.1 整體架構圖 graph TB subgraph Input["...
BioMedLM 完整教學 Repository: https://github.com/stanford-crfm/BioMedLM Stars: 640 | Forks: 66 | Language: Python Tags: biomedical, LLM, Stanford Model Hub: https://huggingface.co/stanford-crfm/pubmedgpt Blog: https://crfm.stanford.edu/2022/12/15/pubmedgpt.html 2. 核心架構 2.1 整體架構圖 graph TB subgraph "Pre-training Pipeline"...
brain-synthesis-lesion-segmentation 完整教學 Repository: https://github.com/harshitAgr/brain-synthesis-lesion-segmentation Stars: 40 | Fork: 33 | Language: Python (TensorFlow) Tags: brain, GAN, NVIDIA-DLI 論文: Medical Image Synthesis for Data Augmentation and Anonymization using Generative Adversarial Networks 最後更新:...