CLIProxyAPI 完整教學 一個 Go proxy，把你買的 Claude Pro / ChatGPT Plus / Gemini Pro CLI 訂閱重新打包成 OpenAI 相容 API。 同時也是 「中國地下 API 中轉站經濟」（koc.com.tw 2026-05-18 報導）的關鍵元件 — 這份教學會把技術與爭議同時講清楚。 ⚠️ 本份教學立場：技術導向、不評斷使用，但明確標示資安、合規、ethics 風險。 1. 專案定位 1.1 一句話介紹 CLIProxyAPI = 拿到一份 Claude Code / ChatGPT Codex / Gemini CLI / Antigravity / Grok...
RFdiffusion 完整教學 把 protein design (蛋白質設計; PD) 從「修改既有結構」推進到「從噪音開始 generate 全新功能蛋白質」。 這份教學涵蓋：原理、安裝、6 種主要 design task、實際 contig 寫法、資安考量、與 ProteinMPNN + AlphaFold pipeline 整合。 1. 專案定位 1.1 一句話介紹 RFdiffusion = RoseTTAFold 結構預測網路 + denoising diffusion model (去噪擴散模型; DDM)。輸入「想要的條件」（motif、binding target、對稱性、長度），輸出「...
Academic Research Skills (ARS) 完整教學 一個 plugin，把學術研究從「找文獻」到「投稿、修審回覆」全部包進 Claude Code。 設計哲學：AI 是副駕，不是駕駛。LLM 結構性缺陷（frame-lock / sycophancy / intent misdetection）由 mandatory integrity gate 強制管控。 1. 專案定位 1.1 一句話介紹 ARS（Academic Research Skills）是 Claude Code 上目前最完整的學術研究 plugin： 4 個 skill 覆蓋全流程：deep-research / academic-paper...
agent-skills 完整教學 一份不浪費你時間的 quick reference + 深度解析。 適合：想知道「能不能用」、「怎麼用」、「會不會中招」三件事的工程師。 1. 專案定位 1.1 一句話介紹 agent-skills 是一個 可信任的 AI agent skill (技能) 註冊中心 — 你可以把它想成 AI coding agent 版的 npm registry，但每個 skill 都經過資安掃描、人工審核與內容雜湊鎖定 (content hashing lockfile)。 1.2 為什麼需要它？ 當前 AI agent 生態的痛點： Snyk Agent Scan 報告：marketplace...
Articraft 完整教學 — Agentic 系統做 articulated 3D asset 生成 ⚠️ 重要資安提醒：Articraft 會把 LLM 生成的 model.py 當 Python 程式碼直接執行（local compile + probe + viewer materialization）。絕對不要直接跑來源不明的 record / 對抗性 prompt 生成的 record。建議用 disposable VM / Docker container / 雲端隔離環境。詳見第 6 節。 對應 metadata 報告：2026-05-17-github-mattzh72-articraft.md...
awesome-design-md 完整教學 — 用 DESIGN.md 讓 AI agent 生出對的 UI 📁 對應 metadata 報告：2026-05-18-github-VoltAgent-awesome-design-md.md 🌐 對應 HTML：projects/awesome-design-md/quarkdown-out/02-tutorial/index.html 1. 專案定位 1.1 一句話定位 DESIGN.md = 設計版的 AGENTS.md。把品牌的「design tokens (設計變數;顏色 / 字型 / 間距 / 元件)」變成一份純文字 markdown，丟到專案 root，AI...
broadinstitute/depmap_omics 完整教學指南 一句話定位：depmap_omics 是 Broad Institute 維護的官方 DepMap 季度資料生產 pipeline。每季把 CCLE 細胞株的 WGS/WES/RNAseq raw data，透過 Terra cloud workflows 處理成 DepMap portal 對外發佈的標準矩陣（CN、Mutation、Expression、Fusion、Dependency）。 對 Apotek 專利的角色：Module 2...
cell2sentence (C2S / C2S-Scale) — 完整教學 把單細胞 RNA-seq 表達矩陣轉成 LLM 看得懂的「cell sentence (細胞句子)」，用大型語言模型做 cell type prediction (細胞類型預測)、cell generation (細胞生成)、perturbation response prediction (擾動反應預測) 等任務。 1. 專案定位 Cell2Sentence (C2S) 是 Yale University van Dijk Lab 於 2024 年提出的 single-cell + LLM 整合框架。最核心的創新是一個極簡的資料表徵轉換：...
celltype-agent 完整教學指南 一句話定位：celltype-agent（CLI：ct）是藥物探索版的 AI coding agent——輸入自然語言問題，AI 自動規劃並呼叫 190+ 計算生物學工具，輸出完整研究報告。 1. 專案定位與核心概念 什麼是 celltype-agent？ celltype-agent 是 CellType Inc. 開源的藥物探索自主代理。它將 Claude Agent SDK 的代理迴圈與 190+ 計算生物學工具組合，讓研究人員只需輸入自然語言問題，就能自動執行多步驟的藥物研究工作流： 1使用者問題 2 │ 3 ▼ 4Claude（規劃 → 呼叫工具 → 自我修正 → 合成） 5...
fireworks-tech-graph 詳細安裝與使用教學 本文件 deep-dive 整理 yizhiyanhua-ai/fireworks-tech-graph 的安裝、設定、API 使用、應用情境，並附上對所有 scripts/ 與 SKILL.md 的資安審查結果。閱讀對象：想把這個 skill 納入個人 / 團隊 Claude Code 工作流的開發者。 1. 專案定位（一句話總結） 把「畫圖」變成「描述」：用中／英文敘述系統架構，幾秒內得到出版品質的 SVG + 1920px PNG。 它是什麼？ Claude Code Skill：以 markdown + Python + Bash 組成的能力包，由 Claude...