前言 親愛的爸爸媽媽： 想跟你們分享一下我們家小寶貝（目前已經 8 個月又 2 天 大囉！）現在每天的作息和一些成長小紀錄。知道你們很關心他，所以整理了這份簡單的「育嬰日誌」，讓你們隨時都能知道小傢伙過得怎麼樣，也讓我們能一起記錄他成長的每一刻！ 這份日誌會包含他每天的吃飯、睡覺、洗澡時間軸，還有這個階段的他有哪些新的小技能，以及我們可以怎麼陪他玩、幫助他發展。 小寶貝的一天：作息時間軸 寶寶的作息基本上是個大約四小時的循環，但我們還是會保持彈性，依他當下的狀況微調喔！ 🍼 第一餐與晨間時光 (約 8:00 AM) 喝奶奶: 這是早安的第一餐！我們會泡 180ml 到 210ml 的牛奶。 奶粉配方: 比例是每 30ml 的水加一...

前言 本教學文件旨在詳細解說一份用於分析人類間質幹細胞 (Mesenchymal Stem Cells, MSCs) 在 2D 與 3D 培養環境下基因表現差異的 R 腳本。我們將使用 Affymetrix HTA 2.0 微陣列平台的數據，並透過一系列生物資訊學工具，從原始數據讀取、標準化、註解，到最終的數據可視化，一步步完成整個分析流程。 本教學適合對象： 對微陣列數據分析有興趣的生物學家或研究人員。 正在學習 R 語言進行生物資訊分析的學生。 希望了解 oligo 和 Seurat 套件在微陣列分析中應用的使用者。 1. 原始數據讀取與標準化 (Oligo 套件) 在分析的第一步，我們需要處理最原始的 .CEL 檔...

教學來源 https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial 本教學以 PBMC3K 資料為例，介紹 Seurat 進行單細胞 RNA 分析的完整流程。 1. 建立 Seurat 物件 1# 清除環境變數，避免影響後續分析 2rm(list = ls(all = TRUE)) 3 4# 載入必要套件 5library(dplyr) 6## 7## Attaching package: 'dplyr' 8## The following objects are masked from 'package:stats': 9## 10## filter, lag 11## The...