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AiZynthFinder 完整教學 — AI 逆合成規劃工具

2026-06-0510 min read Bioinformatics AstraZeneca Building-Blocks Cheminformatics Lead-Optimization MCTS Retrosynthesis

AiZynthFinder 完整教學 — AI 逆合成規劃工具 1. 專案概述 AiZynthFinder 是 AstraZeneca Molecular AI 團隊開源的逆合成規劃工具（retrosynthetic planning tool），也是該領域目前最成熟的開源方案（845 stars，MIT 授權）。核心能力從一個**目標分子（target molecule）**出發，自動找出合成路線（synthetic routes）預設使用 Monte Carlo Tree Search (MCTS) 演算法，以神經網路策略遞迴拆解分子搜尋終止條件：所有葉節點分子都能在**商用試劑庫（stock）**中買到支援多種搜尋...

Tutorial: deepforestsci/DeepRetro — LLM 驅動遞歸逆合成完整解析

2026-06-0511 min read Bioinformatics AiZynthFinder Cheminformatics Claude DeepSeek Drug-Discovery Hallucination-Detection Human-in-the-Loop Lead-Optimization Llm Rdkit Recursive-Llm Retrosynthesis SMILES Tutorial

DeepRetro 完整教學本文目的：把 DeepRetro 的「為什麼要用 LLM 做逆合成」、「整個 pipeline 怎麼運作」、「怎麼跑起來然後接進你的 lead optimization 工作流」一次講清楚。重點放在架構理解、實務操作、幻覺防護機制、以及對你場景的適用性評估。 1. 專案定位與動機 1.1 一句話總結 DeepRetro 是一個開源的混合式逆合成規劃工具 (hybrid retrosynthesis planning tool)，先讓 AiZynthFinder（template-based MCTS engine）嘗試，失敗時再讓 LLM（Claude / DeepSeek-R1）...