AiZynthFinder 完整教學 — AI 逆合成規劃工具 1. 專案概述 AiZynthFinder 是 AstraZeneca Molecular AI 團隊開源的逆合成規劃工具（retrosynthetic planning tool），也是該領域目前最成熟的開源方案（845 stars，MIT 授權）。 核心能力 從一個**目標分子（target molecule）**出發，自動找出合成路線（synthetic routes） 預設使用 Monte Carlo Tree Search (MCTS) 演算法，以神經網路策略遞迴拆解分子 搜尋終止條件：所有葉節點分子都能在**商用試劑庫（stock）**中買到 支援多種搜尋...

Syntheseus 完整教學：模組化逆合成規劃框架 1. 專案定位與核心價值 1.1 什麼是 Syntheseus？ Syntheseus 是 Microsoft Research 開發的 Python 套件，專為逆合成規劃 (retrosynthetic planning) 設計。逆合成分析的目標是：給定一個目標分子 (target molecule)，反向推導出一條或多條從商業可購買的起始物料 (building blocks) 到目標分子的合成路線 (synthesis route)。 Syntheseus 的核心價值在於模組化：它將逆合成問題拆解為兩個可獨立替換的組件—— Single-step model（單步反應模...

DeepRetro 完整教學 本文目的：把 DeepRetro 的「為什麼要用 LLM 做逆合成」、「整個 pipeline 怎麼運作」、「怎麼跑起來然後接進你的 lead optimization 工作流」一次講清楚。重點放在架構理解、實務操作、幻覺防護機制、以及對你場景的適用性評估。 1. 專案定位與動機 1.1 一句話總結 DeepRetro 是一個 開源的混合式逆合成規劃工具 (hybrid retrosynthesis planning tool)，先讓 AiZynthFinder（template-based MCTS engine）嘗試，失敗時再讓 LLM（Claude / DeepSeek-R1）...