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Syntheseus 完整教學：模組化逆合成規劃框架

2026-06-0510 min read Bioinformatics Ai Chemistry Lead-Optimization Microsoft Rdkit Retrosynthesis Search-Algorithms Synthesis-Planning

Syntheseus 完整教學：模組化逆合成規劃框架 1. 專案定位與核心價值 1.1 什麼是 Syntheseus？ Syntheseus 是 Microsoft Research 開發的 Python 套件，專為逆合成規劃 (retrosynthetic planning) 設計。逆合成分析的目標是：給定一個目標分子 (target molecule)，反向推導出一條或多條從商業可購買的起始物料 (building blocks) 到目標分子的合成路線 (synthesis route)。 Syntheseus 的核心價值在於模組化：它將逆合成問題拆解為兩個可獨立替換的組件—— Single-step model（單步反應模...

Tutorial: deepforestsci/DeepRetro — LLM 驅動遞歸逆合成完整解析

2026-06-0511 min read Bioinformatics AiZynthFinder Cheminformatics Claude DeepSeek Drug-Discovery Hallucination-Detection Human-in-the-Loop Lead-Optimization Llm Rdkit Recursive-Llm Retrosynthesis SMILES Tutorial

DeepRetro 完整教學本文目的：把 DeepRetro 的「為什麼要用 LLM 做逆合成」、「整個 pipeline 怎麼運作」、「怎麼跑起來然後接進你的 lead optimization 工作流」一次講清楚。重點放在架構理解、實務操作、幻覺防護機制、以及對你場景的適用性評估。 1. 專案定位與動機 1.1 一句話總結 DeepRetro 是一個開源的混合式逆合成規劃工具 (hybrid retrosynthesis planning tool)，先讓 AiZynthFinder（template-based MCTS engine）嘗試，失敗時再讓 LLM（Claude / DeepSeek-R1）...